Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCNAQ96QF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GCNAQ96QF7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GCNAQ96QF7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GCNAQ96QF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms