Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TEFMQ96QE5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TEFMQ96QE5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TEFMQ96QE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TEFMQ96QE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms