Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TRERF1Q96PN7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRERF1Q96PN7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TRERF1Q96PN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TRERF1Q96PN7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms