Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCLT1Q96NL6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SCLT1Q96NL6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SCLT1Q96NL6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCLT1Q96NL6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms