Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FBXO17Q96EF6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO17Q96EF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO17Q96EF6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms