Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHMP4CQ96CF2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHMP4CQ96CF2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHMP4CQ96CF2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHMP4CQ96CF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms