Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXT2Q93063 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXT2Q93063 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXT2Q93063 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EXT2Q93063 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms