Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
P3H4Q92791 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
P3H4Q92791 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
P3H4Q92791 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms