Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PHF3Q92576 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF3Q92576 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PHF3Q92576 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PHF3Q92576 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms