Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TM9SF4Q92544 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TM9SF4Q92544 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM9SF4Q92544 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TM9SF4Q92544 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms