Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX19Q92543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX19Q92543 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX19Q92543 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms