Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF680Q8NEM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF680Q8NEM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ZNF680Q8NEM1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF680Q8NEM1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms