Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF248Q8NDW4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF248Q8NDW4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF248Q8NDW4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms