Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DNAAF3Q8N9W5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DNAAF3Q8N9W5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNAAF3Q8N9W5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DNAAF3Q8N9W5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms