Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RYBPQ8N488 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RYBPQ8N488 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RYBPQ8N488 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RYBPQ8N488 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RYBPQ8N488 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms