Protein–RNA interactions for Protein: Q8N126

CADM3, Cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM3Q8N126 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CADM3Q8N126 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CADM3Q8N126 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CADM3Q8N126 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CADM3Q8N126 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CADM3Q8N126 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CADM3Q8N126 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CADM3Q8N126 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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