Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXL7

MSRB3, Methionine-R-sulfoxide reductase B3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB3Q8IXL7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MSRB3Q8IXL7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSRB3Q8IXL7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MSRB3Q8IXL7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MSRB3Q8IXL7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms