Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD163Q86VB7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD163Q86VB7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD163Q86VB7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms