Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RPAINQ86UA6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAINQ86UA6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RPAINQ86UA6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RPAINQ86UA6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RPAINQ86UA6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms