Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7D3

VTCN1, V-set domain-containing T-cell activation inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTCN1Q7Z7D3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTCN1Q7Z7D3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VTCN1Q7Z7D3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
VTCN1Q7Z7D3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VTCN1Q7Z7D3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms