Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RD3Q7Z3Z2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RD3Q7Z3Z2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RD3Q7Z3Z2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RD3Q7Z3Z2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms