Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUP54Q7Z3B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUP54Q7Z3B4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP54Q7Z3B4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP54Q7Z3B4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms