Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
OTOP3Q7RTS5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
OTOP3Q7RTS5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
OTOP3Q7RTS5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
OTOP3Q7RTS5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms