Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NLRP9Q7RTR0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NLRP9Q7RTR0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP9Q7RTR0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NLRP9Q7RTR0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms