Protein–RNA interactions for Protein: Q7M4L6

SHF, SH2 domain-containing adapter protein F, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHFQ7M4L6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHFQ7M4L6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHFQ7M4L6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SHFQ7M4L6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SHFQ7M4L6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms