Protein–RNA interactions for Protein: Q7L576

CYFIP1, Cytoplasmic FMR1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1Q7L576 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYFIP1Q7L576 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYFIP1Q7L576 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYFIP1Q7L576 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CYFIP1Q7L576 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYFIP1Q7L576 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms