Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHSY3Q70JA7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHSY3Q70JA7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHSY3Q70JA7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms