Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf139Q6ZV77 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C9orf139Q6ZV77 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C9orf139Q6ZV77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf139Q6ZV77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms