Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RBM43Q6ZSC3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RBM43Q6ZSC3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RBM43Q6ZSC3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RBM43Q6ZSC3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms