Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC55Q6ZSA7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC55Q6ZSA7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC55Q6ZSA7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC55Q6ZSA7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms