Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMK1

CYHR1, Cysteine and histidine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYHR1Q6ZMK1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CYHR1Q6ZMK1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CYHR1Q6ZMK1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CYHR1Q6ZMK1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CYHR1Q6ZMK1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms