Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C16orf54Q6UWD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C16orf54Q6UWD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms