Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EMBQ6PCB8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMBQ6PCB8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMBQ6PCB8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EMBQ6PCB8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms