Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RHBDD2Q6NTF9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RHBDD2Q6NTF9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHBDD2Q6NTF9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms