Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRNP1Q6NT89 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRNP1Q6NT89 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRNP1Q6NT89 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRNP1Q6NT89 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms