Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
VIRMAQ69YN4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
VIRMAQ69YN4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
VIRMAQ69YN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
VIRMAQ69YN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
VIRMAQ69YN4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms