Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUPD1Q68J44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DUPD1Q68J44 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DUPD1Q68J44 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DUPD1Q68J44 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms