Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM46CQ5VWP2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM46CQ5VWP2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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