Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms