Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1A1P5Q5VTE0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EEF1A1P5Q5VTE0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EEF1A1P5Q5VTE0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms