Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CEP350Q5VT06 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CEP350Q5VT06 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CEP350Q5VT06 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CEP350Q5VT06 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CEP350Q5VT06 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms