Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNAP47Q5SQN1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SNAP47Q5SQN1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNAP47Q5SQN1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms