Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWF7

FBXO48, F-box only protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO48Q5FWF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO48Q5FWF7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO48Q5FWF7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO48Q5FWF7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO48Q5FWF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms