Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB6CQ53S08 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RAB6CQ53S08 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB6CQ53S08 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB6CQ53S08 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms