Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

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Length 785 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK7Q16549 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PCSK7Q16549 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCSK7Q16549 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCSK7Q16549 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCSK7Q16549 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK7Q16549 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK7Q16549 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK7Q16549 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCSK7Q16549 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
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