Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SURF2Q15527 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SURF2Q15527 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SURF2Q15527 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms