Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ELOBQ15370 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ELOBQ15370 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ELOBQ15370 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms