Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDCD1Q15116 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PDCD1Q15116 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDCD1Q15116 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PDCD1Q15116 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDCD1Q15116 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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