Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCLAFQ15004 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCLAFQ15004 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCLAFQ15004 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCLAFQ15004 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCLAFQ15004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCLAFQ15004 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCLAFQ15004 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
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