Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
SCARF1Q14162 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
SCARF1Q14162 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SCARF1Q14162 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCARF1Q14162 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
SCARF1Q14162 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
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