Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1DQ13901 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C1DQ13901 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1DQ13901 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1DQ13901 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C1DQ13901 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1DQ13901 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1DQ13901 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C1DQ13901 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1DQ13901 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1DQ13901 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1DQ13901 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1DQ13901 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1DQ13901 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1DQ13901 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1DQ13901 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
C1DQ13901 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1DQ13901 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1DQ13901 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1DQ13901 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1DQ13901 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1DQ13901 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1DQ13901 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1DQ13901 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1DQ13901 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1DQ13901 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1DQ13901 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1DQ13901 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1DQ13901 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1DQ13901 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1DQ13901 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1DQ13901 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1DQ13901 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1DQ13901 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1DQ13901 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1DQ13901 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1DQ13901 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1DQ13901 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1DQ13901 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1DQ13901 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1DQ13901 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1DQ13901 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
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